三本木高校における中高一貫教育は、高等学校入学者選抜を行わず、中学校と高等学校を接続させる教育制度。中高の接続により、6年間の計画的かつ継続的な一貫した教育を行い、生徒の進路希望の達成を目指す教育制度。